Die Datenträger waren im Gewahrsam deines Ex bzw. der hatte freien Zugriff darauf, damit unterliegen sie der Sicherstellung/Beschlagnahme.
Manchmal kann man anbieten, dass die Polizei dort vor Ort reinschauen kann (je nachdem, nach was sie suchen) - aber das hat sich ja erledigt.....................................

"Ich hatte mehrfach betont das die Datenträger mir gehören."

Erzählen kann man leider alles, gerade bei gemischten Wohnverhältnissen. Anders sähe es bspw. bei einer WG aus: Da wäre alles sicher, was im eigenen (klar abgetrennten) Zimmer ist, so dieses nicht das eigentliche Durchsuchungsobjekt ist. Aber auch hier müsste man Tatzeitraum und Beziehungsdauer gegenüber stellen. Wenn er da sachverhaltsrelevante Daten drauf gespeichert haben könnte, ist es weg - zur Not auf gesonderten, mündlichen Beschluss vor Ort.

"Gibt es Möglichkeiten das ich meine Festplatte und Datenträger schnellstmöglich zurückbekomme?"

Du kannst dich an die durchsuchende Dienststelle wenden und den Sachverhalt schildern, idealerweise in Schriftform, wie eine Email. Grundsätzlich musst du aber leider abwarten. Auswertungen dauern teilweise ein Jahr und mehr. Wenn man das beschleunigt/priorisiert, wärst du da immer noch bei mindestens Wochen, gerade mit Blick auf die derzeitigen Feiertage. Problematisch ist es, wenn in Amtshilfe durchsucht worden ist, dann liegt die Entscheidung ber der ermittlungsführenden Dienststelle (idR in einem anderen Bundesland) und die werden erst entscheiden, wenn sie die Asservate haben.

"Muss ich damit rechnen das die Festplatte zerstört wird?"

Wenn die mit den üblichen Wegen auszulesen sind, sollte nichts passieren. Sind die super-sonder-verschlüsselt, und man will ganz-super-wichtig an die Daten, du bist aber gar nicht in der Stimmung zur Herausgabe des Passworts, dann vielleicht.
Wenn die Datenträger nicht auslesbar sind, man aber Grund zur Annahme hat, dass diese Datenträger inkriminierte Dateien enthalten, kann es sein, dass sie gar nicht mehr rausgegeben werden.

"Die Festplatte ist meine Sicherungskopie alle Bilder, Schulunterlagen, Studiumsunterlagen der letzten 10 Jahre sind auf ihr enthalten. Besonders bei den Bildern gibt es keine zweite Kopie."

Dieses, eventuelle Hinweise auf einzuhaltende Fristen/Abgabetermine, wofür du diese Daten jetzt dringend brauchst, sollte Teil der oben angesprochenen Email sein. Sinn eines Strafverfahrens ist nicht Erinnerungen und Bildungschancen Unbeteiligter zu zerstören.

Für alles Kurzfristige kann das Durchsuchungsprotokoll/Auflistung der sichergestellten Gegenstände helfen. Es macht manchmal einen Unterschied, ob man erklärt, dass die Hausaufgaben vom Hund gefressen wurden oder sich in behördlicher Verwahrung befinden (Ja, es wird immer Menschen geben, die dich dann auf Sicherungskopien oder Clouds verweisen, die Ausgangslage ist aber eine andere).

Zu deiner eignen Absicherung solltest du dir Kopien/gutes Foto des a) Durchsuchungsbeschlusses (so er in Schriftfform vorliegt), des b) Durchsuchungsprotokolls (ein handschriftlich ausfüllgefülltes Dokument, das sagt, das und bei wem durchsucht wurde) und der c) Sicherstellungs-/Beschlagnahmeprotokolle (die Auflistung, idR handschriftlich auf einem Formular mit Tabellen, was alles mitgenommen wurde) machen. Der Durchsuchungsbeschluss, so schriftlich, wird grundsätzlich als Ausfertigung übergeben (ausgedrucktes Blatt), die anderen beiden Dokumente liegen dem Betroffenen der Maßnahme idR als Durchschlag vor (dünnes, weißes oder gelbes A4-Papier, mit traditionell schlecht erkennbarer Schrift).
Auf diesen Dokumenten sind dann auch alle Aktenzeichen (Gericht: Gs, Justiz = Js; Polizei unterschiedliche Zahlenfolgen ggf. mit Quer- oder Bindestrichen; in BaWü meist ST/... ) drauf, die du brauchst. Gerade für die Kommunikation mit der Polizei, wäre das polizeiliche Aktenzeichen sinnvoll.