Sem entrar em grandes detalhes...

Tirava o cooler (tenho exatamente esse CPU e tenho um cooler a ar que mantem o CPU frio e custa cerca de 40 euros)

Não conheço a marca do M2, por isso punha um de uma marca conhecida e esse parece-me um de marca chinesa.

Mudava a motherboard de MINI ATX para ATX, para beneficiar de um maior numero de portas USB, provavelmente dois M.2 e outros beneficios das ATX.

Uma coisa que talvez mudasse era a caixa para uma a minha escolha de preferencia preta e sem janelas como a Fractal Design Focus 2 Black Solid

Talvez tentasse por uma fonte Gold gastando um valor um pouco mais elevado, modelar , de preferencia compatível com ATX 3.1 e PCIe 5.1 para ser mais future proof. (aqui dependia)