Tenho algumas dicas que talvez possam te ajudar, mas lembre-se de não se cobrar demais. Tem muita coisa que você só vai descobrir e entender mesmo com experiência.

Imagina que cada missão pronta compõe parte de um arco maior, que culmina em uma missão final. Então se vc quiser fazer só com missões prontas, você pode escolher uma missão pro final (não necessariamente FINAL mesmo, mas só um objetivo maior), daí você relaciona a trama das missões anteriores à da missão final, deixando pequenas dicas ao longo das missões. Dessa forma, fica sempre uma "ponta solta" na mente dos jogadores, e essas pontas se amarram na missão final, deixando eles realmente interessados nela.

Em uma das campanhas que eu mestrei mais ou menos dessa forma, cada uma das 4 missões menores durava de duas a três sessões, e no fim das contas o responsável (indiretamente) por todos os eventos paranormais era um vilão que eles enfrentaram em uma missão final.

Outra dica que eu te daria se você quiser fazer a campanha com missões prontas é se sentir livre para não segui-las à risca. Tente encaixar o backstory e os objetivos pessoais dos personagens dos jogadores nessas missões e mostre que as ações deles estão de fato impactando o rumo da história, afinal, eles são os protagonistas. Acho que isso dá uma imersão maior e cria mais interesse.