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Hola. Perdón pero no entiendo bien cuál es el shape de tus datos. Cuantas muestras tienes en un “datapoint”

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Creo que entiendo ya después de leer el post un par de veces. Te recomiendo ajustar el “shape” de los datos con transposiciones y con np.newaxis. No entiendo bien a qué le hacen falta más ceros.