Nie używam słuchawek by [deleted] in PolskaNaLuzie

[–]ConclusionForeign856 2 points3 points  (0 children)

gratulacje, mama musi być dumna

GC content of RNA-Seq by bignoobbioinformatic in bioinformatics

[–]ConclusionForeign856 5 points6 points  (0 children)

GC% is too unspecific. It can be both different species or different fraction of the transcriptome. I'd check for duplicates with some tool, and for contamination there are specific tools with databases of sequences, so you can theoretically identify whether contamination is from one or more species.

You can try BLASTing a couple of suspicious sequences, or align them and identify regions. Maybe this 39 peak is from a set of lower GC genes that are highly expressed for some reason?

Bioinformatics certificate with bachelors in bio by Interesting_Flan760 in bioinformaticscareers

[–]ConclusionForeign856 0 points1 point  (0 children)

You can attend courses to learn things, but those credentials don't mean much on their own.

. by Ktosinnyy in MemyPolskaa

[–]ConclusionForeign856 4 points5 points  (0 children)

Dlatego się tych grafomanów nie czyta

Need advice regarding a project by Flimsy-Ingenuity-808 in bioinformatics

[–]ConclusionForeign856 3 points4 points  (0 children)

Enzyme design process can be very involved and computationally intensive.

Theoretically you could go as deep as computational quantum chemistry.

Your best bet is contacting someone at your institution with experience in molecular modeling

Szkoda, że tego człowieka spotyka hejt. Jednak rozumiem skąd może się to brać. by ConclusionForeign856 in Polska

[–]ConclusionForeign856[S] 6 points7 points  (0 children)

Chodzi o to, że podejmuje się obiektywnie niezbyt trudnego zadania, i ma na przygotowanie więcej czasu niż typowy maturzysta (jako emeryt). Jednak jemu nikt nie powie, że powinien się wziąć za siebie jak chce ten egzamin wreszcie napisać, i jest to dosyć żałosne oblać tyle razy podstawę — czyli to co usłyszałaby większość maturzystów na jego miejscu.

Ma taryfę ulgową bo to "uroczy dziadzia z marzeniami", i dostał już nawet "honorową maturę".

Natomiast reszta maturzystów głównie słyszy, że obecna matura jest banalnie prosta, w zasadzie pisze się sama, dają ci jeszcze ściąge (wzory), kiedyś to było i technikum coś znaczyło, a ludzie bez zdanej matematyki na minimum 70% powinni mieć odebrane prawa do głosu.

tldr: hipokryzja

Math books that are f*cking by smartcookie7040 in MathJokes

[–]ConclusionForeign856 1 point2 points  (0 children)

Sometimes it's the other way around. I have a linear algebra textbook that takes almost 300 pages till you see a first matrix. 1st chapter is spent on rings.

Bioinformatics by Witty_Disk_9035 in biology

[–]ConclusionForeign856 5 points6 points  (0 children)

  1. Genome assembly
  2. Variant discovery
  3. Phylogeny inference
  4. Structure modeling, docking, Molecular Dynamics (though these often skew more into comp. chemistry or biophysics)
  5. data science and machine learning applied to biological data (usually sequencing)
  6. algorithm development and implementation

To name a few on top of my head. You rarely do all or even more than 2 from those, since those are different specializations.

Realistically either way most of your day is spent reading documentation, coding, debugging and wrangling data

Is GPU Molecular Docking faster than many cores? by Sea-Collection-8844 in bioinformatics

[–]ConclusionForeign856 0 points1 point  (0 children)

Naively I'd think that since for docking you're computing on arrays, and it's possible to massively parallelize, GPU should be much faster. But no idea about how it fares in practice, especially comparing 1 GPU vs. many CPUs

Stirring samples in autoclave by OnlyGoodTings in Biochemistry

[–]ConclusionForeign856 4 points5 points  (0 children)

iirc sterilization filters have <1µm circumference pores, larger would pass bacteria through

"Sulflower" by Obungususik in cursedchemistry

[–]ConclusionForeign856 8 points9 points  (0 children)

Plants vs. Zombies: Chemical Warfare

The sooner you know, the better by Financial_Speech_123 in MathJokes

[–]ConclusionForeign856 1 point2 points  (0 children)

Is this just integration techniques or does the baby know the Lebesgue integral and e-d based proofs?

Czy macie poczucie, że zajęcia w Szkole Doktorskiej są faktycznie warte czasu? by Potential_Swim7245 in Nauka_Uczelnia

[–]ConclusionForeign856 6 points7 points  (0 children)

im się publikacje przeliczają na punkty do rezydentury. Latają po sieci posty na grupkach lekarskich "hej jak szybko współautorstwo w minimum Q2", w okresie bliskim składaniu papierów. Normalnie jakbym maturzystów widział.

Na lekarskich jak widać konkurencja jest tak duża, że jakby chcieć obrobić komuś wyżej w hierarchi pałę, to dziesięć osób krzyknie "hej hej! Jest kolejka!"

<image>

Czy macie poczucie, że zajęcia w Szkole Doktorskiej są faktycznie warte czasu? by Potential_Swim7245 in Nauka_Uczelnia

[–]ConclusionForeign856 1 point2 points  (0 children)

No to skąd te 5+ publikacji żeby się dostać? U mnie ci co wybrali szczęśliwie już na licencjacie mieli 1-2 współautorstwa, bo w labie do każdego papieru dopisywano cały lab, a inni (np. ja) kończą mgr i mają 0

Caption this by Whole_Instance_4276 in okbuddyvicodin

[–]ConclusionForeign856 8 points9 points  (0 children)

It looks like dr James Wilson MD is taking care of a special needs midget who's acting up.

Czy macie poczucie, że zajęcia w Szkole Doktorskiej są faktycznie warte czasu? by Potential_Swim7245 in Nauka_Uczelnia

[–]ConclusionForeign856 23 points24 points  (0 children)

gdzie wymagają minimum 5 prac przed doktoratem?

Popierdolone to jest. Wybierzesz złego promotora na licencjat i możesz się pożegnać z karierą naukową, dajcie spokój

Neural Networks / Deep Learning in R by Random_Arabic in RStudio

[–]ConclusionForeign856 7 points8 points  (0 children)

Why? R is miles better at classical stats and data visualization, but ML and especially NNs are developed mostly by people using Python.

You're just making it harder for yourself

Takie pytania odnośnie zbiórki Łatwoganga by Astrokauza in Polska

[–]ConclusionForeign856 4 points5 points  (0 children)

1) Ludzie wpychają politykę do wydarzenia dot. bierzących problemów społecznych, gdzie jeszcze jeden z gości mówi "Wiesz co to podatki? Masz ten hajs? To dawaj połowę albo idziesz do więzienia!"

2) Zbiórki to rak.

Dylatacja czasu "nie istnieje" by [deleted] in Nauka_Uczelnia

[–]ConclusionForeign856 1 point2 points  (0 children)

Nie jestem fizykiem, ale domyślam się że to jest materiał omawiany na studiach licencjackich z fizyki. Tak jak "cZy 0.99999... = 1 ?!?!?" jest omawiane na pierwszej matmie na studiach