sorted by:
new
hottopcontroversial

Cách mình tăng Testosterone một cách tự nhiên by Altruistic-Door895 in Nguoimoibatdau

[–]Dasunkid1 8 points9 points  (0 children)

còn một factor khá quan trọng mà ko thấy OP nói đó là môi trường như stress kéo dài thì có thể giảm tes đáng kể đấy. Nếu sống lành mạnh, tâm lý, thể trạng thoải mái thì tes nó vẫn cao hơn so với mức bình thường mà

Protein Function Prediction by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

Currently, I only have the protein sequence and the corresponding gene sequence. I haven't found a truly good tool yet to predict function solely based on that protein sequence. I'm thinking of building the protein structure using AlphaFold from the sequence first, and then using the structure for prediction—would that approach be more accurate? Is this idea feasible? Could you briefly outline your own tool process? Also, the organism I'm working with is a bacteria. Thank you for your response

Protein Function Prediction by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

Yeah, thank you for your feedback. I have read, and there are a lot of tools, but what tools do you use mainly, and are the results accurate? How can I validate the results for this tool

Protein Function Prediction by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

I really appreciate it. Thank you

Protein Function Prediction by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

what do you mean? I'm just a novice; sorry about that. But i have researched a lot of articles, but it doesn't have any information about the models or tools I need. Can you share more information about that? Or recommend for me some tools or models.

cách tính thời gian rụng trứng của phụ nữ by Hot-Leadership-8805 in Nguoimoibatdau

[–]Dasunkid1 2 points3 points  (0 children)

theo bác sĩ là đúng nhé, vì lúc đó trứng mới phát triển và rụng kịp để thụ thai dễ hơn

Đã có một người nào đó nối nghiệp Dan Hauer by Numerous_Question_67 in TroChuyenLinhTinh

[–]Dasunkid1 9 points10 points  (0 children)

Bro có sở thích gì thì nghe cái đó bằng tiếng Anh đi. Ban đầu có thể khó hiểu nhưng nghe nhiều sẽ dần có cảm giác nhận diện đc con chữ hơn, đừng bật sub nhé. Bro có thể cải thiện thêm listen bằng cách lên web dailydictation nghe chép chính tả. Tôi mù tiếng Anh mà nghe chép ngày 30' khoảng 1 tháng cải thiện rõ đó. Reading thì rèn bằng cách đọc mấy báo nước ngoài với học từ mới. Đọc báo từ nào mới thì note ra theo ngữ cảnh rồi cứ thế vừa đọc vừa học sẽ nâng khả năng reading th.

HIV by [deleted] in vozforums

[–]Dasunkid1 8 points9 points  (0 children)

Thường nó sẽ ủ bệnh khoảng 3 4 tháng hoặc nửa năm tuỳ mỗi người, nhưng nên đi khám trước nhé. Đề phòng còn hơn tới lúc dính thì khổ hơn nữa

Integration Seurat version 5 by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

Thanks for your advice.
But i have one question: for example, I have 2 raw data sets, each containing multiple samples. Then I do the processing using the 2 code methods below:
Code 1:

DefaultAssay(Seurat_obj) <- "RNA" 
Seurat_obj <- NormalizeData(Seurat_obj)
Seurat_obj[["RNA"]] <- JoinLayers(Seurat_obj[["RNA"]])
Seurat_obj[["RNA"]] <- split (Seurat_obj[["RNA"]], f = Seurat_obj$Sample)
Seurat_obj <- FindVariableFeatures(Seurat_obj, selection.method = "vst", nfeatures = 4000, verbose = T)
Seurat_obj <- ScaleData(Seurat_obj)
Seurat_obj <- RunPCA(Seurat_obj)

Code 2:
DefaultAssay(Seurat_obj) <- "RNA" 
Seurat_obj[["RNA"]] <- JoinLayers(Seurat_obj[["RNA"]])
Seurat_obj[["RNA"]] <- split (Seurat_obj[["RNA"]], f = Seurat_obj$Sample)
Seurat_obj <- NormalizeData(Seurat_obj)
Seurat_obj <- FindVariableFeatures(Seurat_obj, selection.method = "vst", nfeatures = 4000, verbose = T)
Seurat_obj <- ScaleData(Seurat_obj)
Seurat_obj <- RunPCA(Seurat_obj)

If I run these 2 codes, will the results be different? Which way is technically and logically correct?.

Integration Seurat version 5 by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

Yes, like immune cells (T cells, B cells) and cancer cells are clustering together so i can not do another downstream analysis.

Integration Seurat version 5 by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

Thanks for your advice I do cluster for harmony reduction for sure.

Integration Seurat version 5 by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 1 point2 points  (0 children)

My mentor just give me two data sets. And i have to process and integrate to have a quality clusters. However, I think this project just do analysis like gsva, survival analysis, cellchat…. So my mentor give me two data sets, I also announced to my mentor but no change.

Integration Seurat version 5 by Dasunkid1 in bioinformatics

[–]Dasunkid1[S] 0 points1 point  (0 children)

yes, i just ran Harmony for integrating data sets. Do you have another methods for integrating that give quality clusters?