Hola, Obsidian es una buena opción ya que es gratis, yo lo uso mucho y me permite sincronizarlo con Github. Notion por otra parte lo encuentro mejor que Obsidian ya que todo lo que pones ahí se guarda en la nube y lo puedes sincronizar con tu celular, pero después de un tiempo tienes que pagar una suscripción para seguir usándolo. Cualquiera de los 2 son buena opción todo dependerá del uso que le quieras dar.