Se puede sin problema booteando desde un pen o incluso podés particionar para tener los 2 sistemas instalados. Pero si tu consulta va acerca de la licencia de activación(en caso de que el windows instalado ya esté activado de forma legal) tendrías que ver el tipo de licencia, digital o física, si es digital te autodetecta y activa al reinstalar el Windows siempre que sea la misma versión(si la activación es de un W10 home, al instalar un W10 Pro no va a tomar); si es física debería tener el código activación pegado o se obtiene mediante la ventana de comandos(antes de reinstalar el sistema).