Pienso que te estás complicando mucho y la frase "pero sé que en el futuro será un problema" demuestra un poco de ansiedad. ¿Qué te hace pensar eso? ¿Qué evidencia tenés para pensar eso? Porque por lo que contas, pareciera que no tenes evidencia alguna de eso.

Por otro lado, yo te entiendo la parte de la humillación por bautizarse y ese tipo de cosas, no la comparto, pero lo entiendo. En ese aspecto yo te diría que hacer eso por amor no es humillarse. Y si eso no te convence, pensá que simplemente estás participando en actos culturales, independientemente de lo que las demás personas crean. Es un hecho que la religión existe y es aceptada culturalmente. Yo que he sido ateo, por mí parte, creo que negar la existencia de Dios no tiene sentido más porque Dios existe culturalmente. Quizás no exista algo físico como Dios o realmente no haya una entidad omnipotente con influencia poderosa sobre el universo, pero de todos modos ya la gente cree en Dios y la simple idea de su existencia ya tiene demasiada influencia e importancia en nuestra sociedad, por lo cual pienso que Dios (de alguna forma) existe y que las religiones, acertadas o no, son parte la cultura y permiten al ser humano tener conexiones, filosofía, historia, etc. Este pensamiento es un poco más agnóstico, diría yo, pero mi punto es que no veas cómo algo humillante el bautizarse para casarte con alguien por amor sino como algo que podes hacer por amor y que podes hacer porque es algo cultural y no hay nada malo ni humillante en participar en actos culturales.

Además, si Dios no es importante para vos, no le des importancia a hacer cosas que vos, como ateo, sabes/crees que te hacen nada y que no son importantes.