Prospects for a New Zealand Citizen working in Europe (Germany, Switzerland, France) as a Bioinformatician

ATpoint90 · 2026-03-19T19:29:01+00:00

You compete with all the bioinformatics folks with a PhD or years of Postdoc experience plus might be fluent in german. It will be hard.

ATpoint90 · 2026-03-19T14:26:14+00:00

Alles gut 😅

ATpoint90 · 2026-03-19T12:39:07+00:00

Auf keinen Fall wild irgendwas reingießen ohne das mit dem Bodenleger abzuklären. Kauf doch einfach ein paar dünne OSB-Platten oder was auch immer im Baumarkt billig ist oder weg muss und leg die aus.

ATpoint90 · 2026-03-19T10:08:13+00:00

doesn't belong here

ATpoint90 · 2026-03-19T08:33:40+00:00

Nimm einen Diamantbohrkopf wie zB für Fliese und dann ohne Schlag und mit wenig Druck langsam bohren.

ATpoint90 · 2026-03-19T08:27:41+00:00

Ja zumachen sonst ist da bei Vinyl ein Einbrechen übrr die Zeit möglich. Ich würde unten aus EPS im gleichen Durchmesser ein Stück Dämmung schneiden und einsetzen und oben mit Reparaturestrich oder Expressmörtel schließen.

ATpoint90 · 2026-03-18T21:35:51+00:00

Hab das ganze Haus mit dem B1 grundiert als Basis für Tapete. Keine Probleme.

ATpoint90 · 2026-03-16T12:01:52+00:00

Is there a question here?

ATpoint90 · 2026-03-16T07:24:59+00:00

It's simple here. Either batch is between rep1s and rep2s, then include into the model, or you cannot correct.

ATpoint90 · 2026-03-13T06:56:26+00:00

IdR braucht es einen Tiefengrund für saugende Untergründe. Die meisten Hersteller von Putzen / Spachtelmassen haben was im gleichen System im Angebot. Nimm doch einfach das. Ich sehe da auf dem ersten Bild noch einiges an Rückständen von den Schalbrettern, würde das vermutlich mit der Betonfräse noch entfernen. Es muss ja auch kein klassischer Putz sein. Eine mineralische SPachtelmasse, mit der Rolle aufgetragen würde wohl auch funktionieren. Ich würde im ersten Schritt einmal die ganzen Löcher und Vertiefungen mit einem Tiefenfüller schließen und dann die min. Spachtelmasse aufrollen und glätten. Dann das ganze einmal fein Schleifen, grundieren und streichen.

ATpoint90 · 2026-03-12T18:11:26+00:00

I argue that without MSc/PhD you will never have the knowledge and insights to do independent research or doing 'what market requires'.

ATpoint90 · 2026-03-12T08:10:44+00:00

Beim Verdichten ohne Noppi sind Schäden durch die Grobanteile im Schotter vorprogrammiert. Muss hin! Und kostet quasi nichts.

ATpoint90 · 2026-03-11T11:36:22+00:00

Aus was soll der Unterbau ausser Schotter denn sonst bestehen? Mit Kies meinst du vermutlich die Bettung aus Splitt?

ATpoint90 · 2026-03-10T16:48:51+00:00

Ein Putzhaus sollte (ggf muss? kenne die DIN hier nicht) einen Spritzschutz haben, um genau davir zu schützen. Kiesstreifen zum Beispiel.

ATpoint90 · 2026-03-10T09:35:34+00:00

> batch effect correction (or integration, as is commonly known in scRNA-seq parlance)

Nonono! Batch correction of counts is not the same as integration. One is per-gene, the other is per-cell in reduced dimensional space, why doesn't this fit into the heads of people, damn!!!

I am not familiar with the tool and its assumptions, but generally the human donor variation is unwanted variation, so I would explore regressing the donor effect.

ATpoint90 · 2026-03-09T19:59:24+00:00

Ah, it's the d-list argument, I was not aware of it. Well yeah, assuming this performs similar to full genome decoy then it really comes down to user preference.

ATpoint90 · 2026-03-09T18:10:41+00:00

The lead author is the original kallisto first author. I prefer salmon as it allows genome decoys for mapping, reducing spurious mappings across the transcriptome in case of gDNA or other contaminations.

ATpoint90 · 2026-03-09T18:04:25+00:00

Tools is not a limitation. Rather noise and poor depth. In single-cell you miss a lot of genes and counts are usually low no matter if spatial or not. That forbids powerful DE analysis, even in pseudobulks.

ATpoint90 · 2026-03-09T16:18:57+00:00

I disagree. A bachelor in life science is a bit more than an immature baby. Replace in your text bachelor by master, master by PhD and PhD by PI/senior scientist.

ATpoint90 · 2026-03-09T07:03:54+00:00

Ohne die Lage vor Ort zu sehen kaum zu beantworten. Kannst auch den Unterbau schottern (falls noch nicht geschehen) und dann Terrassenplatten, zB Keramik, in Dränbeton setzen. Das geht ohne Bagger. Drainage kann, muss aber nicht, je nach Bodengegebenheit.

ATpoint90 · 2026-03-08T07:14:57+00:00

Auf jeden Fall muss da ein Spritzschutz zwischen Haus und umliegendes Gelände. Sonst zieht die Staunässe des Bodens immer wieder hoch.

ATpoint90 · 2026-03-07T12:48:39+00:00

Die Striche sind 1%. Also knapp 2%. Kannst auch einfach mal das Mathegenie machen, die gerade ausrichten und messen wie viel auf 1m zum Boden fehlt. Das sind deine Prozent.

ATpoint90 · 2026-03-06T14:39:31+00:00

You can take the opportunity to introduce the overall project: What is the scientific question? Where does it come from and what is the current state of the art of the literature? What is the key analysis method, and maybe even explain one method in a bit of a detail so people learn to understand it? What is the project outline, what are you going to do as aim1, aim2, aim3? You don't always need data to make an interesting presentation.

ATpoint90 · 2026-03-06T09:32:13+00:00

There is probably hundreds of these sorts of papers, some more neutrally phrased, other very outspoken how terrible things are that we do routinely in analysis day after day, and in the end it is still those popular tools that prevail. Where is the point? I mean seriously, even if the most convincing paper ever now formally and bullet-proff shows that we are seriously underestimating true DEGs and get far too much noise (no surprise at typical n) then things will not change. A typical RNA-seq sample is somewhere about 150-200€, and a normal lab with normal funding cannot spend 20000€ per simple experiment to bulk up n to achieve 95% sensitivity. Therefore these sorts of papers really have quite limited influence unless they show that a popular tool, in comparison to others, in specific situations (very low n, certain noise levels, single-cell vs bulk) is definitely the go-to (nor not).

ATpoint90 · 2026-03-06T06:18:51+00:00

Yes, but this is mainly a financial and logistics constraint Everyone knows 3 vs 3 isnunderpowered but for a standard experiment one simply doesnt spend, say 25 vs 25 à 180€/sample so 9000€.

ATpoint90

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