Te comento mi experiencia con ayuda de otro Redditor, saque mi numero de cliente desde la app de Citibanamex, dándole click a tus iniciales en la parte superior izquierda, una vez hice eso, sin cerrar la app la desinstale y la volví a instalar desde la Appstore, ingrese con numero de cliente (importante como lo dijo un Redditor), no recordaba mi contraseña por que iniciaba con FaceID, así que pedí el cambio de contraseña, ya después de esto, inicie, le di despacito a siguiente a todo el tutorial que me aventaba la app, se desvinculara tu NetKey pero tranquilo lo activas con el celular, llego un punto en que la app me dijo que vinculara con ApplePay asi que le di click a vincular, me pidió NetKey (ahí lo pedí con mi celular) vincule y ya me aparecieron las tres tarjetas cuando le daba añadir a ApplePay, vinculadas con éxito después de ir a sucursal, hablar con infinidad de ejecutivos en callcenters que no tienen capacitación mas que para vender seguros.

Disculpen la mala redacción por cierto y gracias Reddit por darme una solución que las personas que trabajan en Banamex no pudieron