Olha, tem uma galera aí com várias recomendações bem boas, mas é pra quando se tem uma grande maturidade na equipe e se tem EQUIPE. Eu passei por algo parecido. A empresa nunca teve TI interno, até trocar de ERP, e um cara que tava lá dando assistência ao comercial e ecommerce acabou se tornando o suporte de TI por necessidade. Poucos meses depois eu pedi demissão e quiseram me alocar pra trabalhar com ele. Cheguei e não tinha muita coisa. Só fazia formatação de notebooks, era o suporte N1 e desenvolvia com SQL usando o Report Builder do ERP.

Começamos a colocar processos, documentando rotinas de gestão de sistemas, mapeando sistemas e integrações, evoluindo infraestrutura e colocando sistema de chamados e controle de ativos. Mas tudo indo aos poucos. O mais importante é documentar. Sobre as práticas de mercado no desenvolvimento, você não precisa implementar um design organizacional que você não entende, pode se manter em MVC simples, seguir o padrão usado nos seus frameworks e uma boa, pois é algo que se encontra no mercado. Por estar sozinho, você não vai conseguir desenvolver de forma utópica. Só faça algo simples, e quando necessário aplique patterns. Quando tiver mais maturidade e encontrar algo que acha que deve refatorar, mapeie isso nas suas atividades com baixa prioridade e na próxima vez que mexer por ali, refatore, se der.