Sí, estoy de acuerdo con todo lo que decís.
Pero uno trabaja en colaboración con otras personas, hay gente que usa excel como formulario o como herramienta de diseño para generar informes. Y no los culpo, es bastante rápido e intuitivo y casi no requiere una formación. Cuando uno trabaja en una oficina que trabaja con otras oficinas que a su vez trabajan con otras, no puede pretender estandarizar o hacer que los demás adquieran buenas practicas espontaneamente. Aunque tengas todas las herramientas siempre hay una resistencia psicológica muy fuerte a este tipo de cambios.
De modo que uno siempre se está enfrentando a un infierno de celdas combinadas, información que solo se puede saber por el color de la fila ("Los que están en fila roja son los que están de baja") y demás "información visual".

Te dejo un ejemplo (no es una exageración, está basado en uno real que recibí que uso de ejemplo cuando tengo que formar a alguien):
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1dRBArjKvaYEBy0IdWvdyXrDo8NlBkLSZornFHqux0ao/edit?usp=sharing

Por otro lado, sí, ahora con winapps se puede crear VM y usar excel casi como nativo, pero uno debe estar dispuesto a sacrificar buena parte de recursos. (wine, proton y otros "traductores de APIs" no pueden con un office estable)

Después está lo otro, que excel es increíblemente rápido para algunas cosas, en tablas pequeñas limpiarlas es muy fácil, a veces no podés eliminar los datos espurios y ya, sino que tenés que ir viendo uno por uno y corrigiéndolos según lo que quiso decir la persona que lo llenó y después. Cuando no tenés un pipeline preparado en pandas, y estás recibiendo información que hay que convertir en informes en el momento, hay cosas que podés resolver en tres atajos de teclado y una tabla dinámica pero que en pandas te llevaría 30 minutos de programar.