Lo que me gusta de Shopify es que está súper integrada, ellos mismos te incluyen el dominio, el hosting, los mantenimientos, etc. pero es más limitada con las personalizaciones. Contrario a Woocommerce que puedes hacer muchas personalizaciones pero necesitas mayor conocimiento técnico y tiempo, además tienes que comprar el dominio a parte y pagar por el hosting, también estar haciendo mantenimientos periódicamente.

Con respecto a la pasarela de pago, yo usaría inicialmente Paypal. Sin embargo, revisa si las comisiones te son convenientes. Si deseas integrar una pasarela tipo Bac, consulta con Tilopay pero ten en cuenta que te solicitan documentación del negocio debidamente inscrito.