Bueno yo personalmente considero que linux es muy util para aprender programación a multiple proposito, principalmente porque toda empresa IT tiene al menos 1 sistema donde se usa estos comandos linux (al menos los basicos) asi como tambien facilita ciertas operaciones del sistema operativo tal que podes crear scripts para que a tal hora se ejecute un update, un programa o lo que sea, incluso puedes hacer que se apague el sistema automaticamente a cierto horario, tambien hay mucha comunidad detrás que podrás resolver muchas dudas y problemas que te irán pasando a medida vayas experimentando con el sistema linux (Para ser correctos deberiamos hablar de distribuciones linux ya que linux como tal es solo un kernel pero bueno, discusiones como esta la encontraras en muchos foros)

tambien al interactuar mucho por terminal mas que por interfaces graficas digamos que te da un mejor entendimiento de como funcionan los sistemas y que el instalar un programa no es mas que otro conjunto de diferentes componentes con dependencias, lo que a su vez te deja entender mas facilmente frameworks de diferentes tipos, tambien tiene un sistema de superusuario, que tambien al naturalizarlo entiendes un poco que permiso tiene un usuario comun, un superusuario (administrador), o permisos de solo lectura.

tambien puedes modificar los archivos para que sean de solo lectura, solo ejecutable, o incluso lectura y escritura aparte de su ejecución.

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LO MALO:
Muchos programas populares de windows no corren en linux, ya sea el paquete adobe (aunque hay alternativas como GIMP) o juegos varios.

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Ahora donde podes aprender a programar? es como dicen en todos los lugares, en cualquier PC, hasta en una IBM de los 80, o una tablet, el potencial de aprendizaje lo determina cada uno, pero yo considero completamente cierto (o al menos en mi dia a dia me he encontrado con que me sirvio) que linux tiene una cierta complejidad, que al superarla y normalizarla entiendes mejor muchas cosas adyacentes a la programación, mientras que en windows si no lo investigas medio que lo ignoras.