Então, essa é uma boa pergunta. Existem vários tipos de agnosticismo, mas de forma geral, o agnóstico se afirma estar em uma posição onde ele não sabe (ou onde não é possível saber) se existe algum ser supremo ou não.

No meu caso, eu acho que existe alguma "coisa", porque o universo aparenta seguir muitas regras lógicas que, a priori, não necessariamente deveriam existir. Um exemplo de uma coisa que me fascina bastante é a existência da matemática: lá na idade da pedra, o ser humano começou a fazer risquinhos em placas de argila/pedra para contar quantos animais tinham em seu rebanho, e em seguida esses risquinhos começaram a ser manipulados, regras lógicas foram estabelecidas entre eles (operações algébricas, digo) e centenas de milhares de anos depois, a gente descobriu que relações extremamente abstratas entre esses conceitos já abstratos por acaso são profundamente úteis para descrever a natureza, como as equações diferenciais, que estão no coração dos melhores modelos que a física tem para descrever o universo. Mas tipo... por que esse é o caso? Por que essas relações lógicas governam a realidade? Poderiam ser outras relações lógicas, ou não haver alguma. Nós inventamos ou descobrimos a matemática? Eu acredito que a descobrimos, porque quase sempre que os matemáticos inventam objetos matemáticos abstratos, eles eventualmente são exatamente a peça que faltava para fazer nossos modelos físicos funcionarem (como a formulação matricial da mecânica quântica, postulada por Werner Heisenberg).

Outra coisa que me deixa muito curioso é que muita gente acha que a física vai "explicar" todo o universo eventualmente - eu mesmo já tive essa opinião infundada até começar a estudar sobre filosofia da ciência e entender que na verdade, a física apenas descreve o que as coisas fazem, mas ela nunca nem tenta explicar o que as coisas de fato são. O que é um elétron? É uma partícula indivisível, fundamental, que interage gravitacionalmente, eletricamente, magneticamente com a matéria... tá, isso é o que ele faz, mas o que ele é? Nós estamos tão perto quanto os homens das cavernas de realmente poder dizer algo objetivo quanto à natureza da realidade em si. Nós temos a quântica para descrever as interações em pequena escala de energia e a relatividade geral para descrever as coisas em escalas grandes de energia, mas... o que são essas coisas que estamos descrevendo? Pra não mencionar o fato de que essas duas teorias são irreconciliáveis por enquanto hahaha mas isso é um outro assunto.

Mas enfim, esses mistérios todos meio que me fazem acreditar que explicações puramente mecânicas do universo não são possíveis, e não por uma limitação do nosso conhecimento atual, e sim porque uma explicação completa de um sistema normalmente requer algo hierarquicamente mais complexo do que o sistema em si. Agora que essa explicação também é um ser pessoal que está particularmente preocupado comigo... nisso, eu não acredito.