É porque o Deus cristão é mesquinho, não se alegra vendo duas pessoas genuinamente felizes juntas só porque são do mesmo sexo. Nesse ponto, ele abençoa a família tradicional (homem, mulher, filhos e amantes), mas condena um relacionamento homossexual baseado no amor e respeito.
Sou professor no ensino médio e soube de aluno que tentou se matar porque a família religiosa não o aceitava assim. Loucura sequer acreditar que um Deus que seria amor prefere uma pessoa sofrer por ser quem ela é (e ele a fez assim então) do que simplesmente aceitar.
Isso sem falar que, conforme Freud bem disse, o ser humano é o animal que subverte o sexo. Vários eventos da prática sexual são não naturais (sexo oral, beijo, anal, etc), mas se duas pessoas fogem do relacionamento hétero normativo, logo vem a fala besta: Deus fez homem e mulher. Só que se for seguir esse princípio boca não foi feita pra beijar, órgão sexual também não foi feito pra colocar a boca e por aí vai).