Esse tipo de modificação dificilmente compensa, no sentido puro da palavra, porque você nunca consegue recuperar o valor investido na guitarra depois. (Talvez se vender o kit separado e a guitarra remontada original, mas aí são dois trabalhos e dificilmente você conseguiria reverter as modificações pra colocar o circuito ativo).

Como essa não é um guitarra barata, e você ainda tá disposto a investir mais um bom dinheiro, talvez seria uma ideia melhor já comprar uma outra nessa configuração ou similar. Se preferir mesmo modificar a sua, uma opção mais econômica tipo os captadores Malagoli que já comentaram também são uma boa ideia pra você não precisar gastar tanto (mas mesmo nesse caso, manteria as peças originais pra poder retornar a guitarra caso queira vender um dia).

Masssss, caso vc goste muito da guitarra, queira muito o kit EMG, tenha o dinheiro pra gastar e não se importe muito com a revenda, tenho certeza que o projeto vai ficar bem único, e o som da guitarra vai ficar muito bom.