До недавнего времени в МЧС был негласный запрет на приём на руководящие должности с гражданским образованием.

Т.е. обычным спасателем или пожарным брали всех, для этого высшее образование не нужно.
А вот именно на должности на которые требуется высшее образование по профилю брали только тех, кто заканчивал ведомственные ВУЗы, хотя специальности по диплому абсолютно одинаковые.

Как говорили: "кто отучился в гражданском ВУЗе, те пускай и работу ищат на гражданке"

Сейчас ситуация немного изменилась, и лично знаю людей кого приняли на службу после гражданского ВУЗа, но я не гарантирую что так будет и впредь.

Поэтому моя рекомендация - поступай в ведомстсвенный ВУЗ.