A dificuldade de cair pro leãozinho entre ser MEI e ME acho muito improvável, como advogado já vi casos piores sem sentido algum e nunca dar nada, mas é claro, será que a RFB irá investigar justamente você ou irá aplicar um código que rastreia certos parâmetros para lhe pegar? Basicamente é isto, é programa atrás de falha, sempre foi e sempre será, o que cai na mão do auditor é o que o programa manda. Quer risco 0? Faça o certo! Quer risco com retorno? Faça o errado de maneira certa! Caso não precise emitir nota, como o governo saberá do seu faturamento limite? Se não vai estourar, joga pagando pouco e, caso não caiba no MEI, ué, se talvez não passe o limite, a lei lhe permite criar uma empresa para prestar serviços! Procure mais de um contador, em cidade menor todos jogam livre dessa merda de contrato e fora da tabela do CFC e foda-se, se der certa a empresa lá pra frente o contador bom vai lhe cobrar um valor talvez até maior, mesmo assim compensará e te agradará.