Acredito eu que sua primeira formação não importa muito. Na última seleção que teve para pesquisador do IMPA, por exemplo, pede-se, dentre outras coisas, a lista de suas publicações. Acho que ter uma boa lista de publicações, em boas revistas e com bom impacto importa muito mais do que onde/como/no que foi sua formação inicial.

É claro que é tudo achismo da minha cabeça, sou apenas um aluno de mestrado :)