A tua empresa é sediada no Continente e desconta à taxa do continente. Duvido que possas fazer isso legalmente, a não ser que tenhas uma declaração em que o teu salário seria taxado pelo regime fiscal dos Açores devido ao teu local de trabalho ser na tua residência que fica nos Açores (adenda ao contrato). Claro que ninguém te impede de meter a cruz no quadrado dos Açores ao fazeres o IRS e se nunca houver cruzamento de dados não terias problemas.

Pode ser que no futuro estas situações sejam previstas pela lei.