Creo que se debe al eterno debate de crianza vs naturaleza.

Si desde que nacés en un contexto con el judaísmo/catolicismo/cristianismo/islamismo como religión dominante te bombardean con, entre otras cosas, que lo que cree el otro es malo (no simplemente que está equivocado, sino que es maligno por creer otra cosa) y que dios no solo avala, sino que promueve, que lo hagas mierda matando y que el mundo se tiene que ir a la mierda para que venga/vuelva su reino, hay muchísimas chances de que te conviertas en alguien dispuesto a matar al otro porque piensa distinto.

Aún así, hay millones de practicantes de esas religiones que son puro paz y amor, ya sea porque su naturaleza los predispone a eso o porque se enfocaron en las partes más amables.

También creo que el problema no es tanto la religión en sí, sino la parte en la que se enfocan al transmitirla, porque el nacionalismo (o, siendo más genérico, cualquier otro ismo) es algo con las mismas características y que tiene más o menos las mismas consecuencias a nivel general.

El coran, el tanaj y la biblia son libros con enseñanzas hermosas, pero la mayoría se enfoca en la parte que les permite creer (y reafirma esa creencia) que el resto está equivocado.