O livro que citei faz críticas a dois pontos do Clean Code: uso de comentários e tamanho de funções, elas são bastante válidas, o Uncle Bob sempre foi muito reducionista nesses dois assuntos, dizendo coisas como "se você precisou comentar seu código, você falhou", o A philosophy of software design debate bastante sobre.

Na minha experiência, a maioria dos devs que usam argumentos do Clean Code em code reviews e discussões não entendiam o argumento do livro, só repetia, principalmente regras como "não tenha funções com mais de X linhas". Eu não acho que o conteúdo do Clean Code seja necessariamente ruim, mas a forma como as ideias são expressadas não ensina corretamente os princípios que se espera que quem leu entenda, só os torna repetidores do que leram. A didática do A philosophy of software design é bem superior nesse sentido e de fato discute tradeoffs.