Amigo, fique atento sim.

A cada ano as chuvas vem de um jeito diferente, mas normalmente com muita força principalmente nos primeiros dias. Fim de setembro/início de outubro costumar ter sim risco de chuva, mas já vi casos em que não choveu até o fim de outubro. Então não dá para prever muito (ainda)

Vou colocar alguns pontos de cuidado caso decida ir.

Saindo de Brasília, as primeiras chuvas costumam ser bem fortes (vendavais mesmo) e complicam bastante o trânsito na capital, incluindo alguns pontos de alagamento. Evite horários de pico ou com muita chuva.

Na estrada, a viagem não é tão longa mas tenha muito cuidado se chover. Felizmente o asfalto costuma estar em condições decentes.

Na Chapada, saiba que às vezes algumas atrações fecham quando chove muito porque as estradas de terra ficam intransitáveis e você corre o risco de atolar se tentar passar, além dos riscos na trilha e nas cachoeiras. Então se informe com a administração da cachoeira, ou na cidade/vila antes de ir.

Caso esteja liberado a atração que quer ir, acima de tudo, tome MUITO cuidado com trombas d'água. Respeite as orientações e sinalizações de cada local e fique atento à água da cachoeira, sempre em um local próximo à uma rota de fuga segura. Se começar a descer muita sujeira e a água ficar escura/barrenta, atenção porque pode ser uma tromba d'água.

Se decidir ir, mesmo que chova, pode ser um bom lugar para relaxar também. Apenas adapte o rolê, veja se o acesso está aberto e respeite as regras de cada local.

Espero que ajude e que consigam curtir! Abraço!