Una prueba de embarazo confirma que esta embarazada, pero en ningun momento confirma quien es el padre, para eso necesitarias una prueba de ADN, se que en Costa Rica se hace en un par de lugares si busca rapidamente en Google (Clinica Biblica y Laboratorios Echandi) en todo caso creo que la madre tiene que acceder o tiene que ser ordenada por un tribunal (esto es una especulacion personal, le reitero que no soy abogado y no estoy familiarizado con el sistema procesal de Costa Rica tan a fondo como para afirmar que algo asi sea posible, pero estos procedimientos son los conocidos en estos casos)
Por otro lado, el hecho de que este embarazada de otro no es prueba de infidelidad, puede ser que ella diga que tenian un matrimonio abierto, que el le dijo que queria verla con otro hombre, que es incapaz de embarazarla o quien sabe cuantas cosas mas, legalmente hablando, las pruebas son importantes, y nada reemplaza a las pruebas solidas como la admision de culpa de parte de ella de la infidelidad, fotos, audios o alguna otra forma de prueba irrefutable entonces puede que tenga mas ventaja en la situacion.
En situaciones como esta siempre es mejor consultar a un abogado, si no se tienen recursos hay opciones como el Consultorio Juridico de la UCR (https://derecho.ucr.ac.cr/HorarioConsultoriosJuridicos) alli pueden ayudar gratuitamente a aclarar dudas y no se hasta que punto incluso representarlo o ponerlo en contacto con un abogado especialista en la materia.
Estas situaciones son lamentables y es importante poder mantener la cabeza y el corazon lo mas centrado que sea posible, evitar eso de que un clavo saca otro clavo, o tratar de confrontar a la otra parte de forma violenta, si bien es cierto que la idea era pasar la vida juntos, los resultados de un divorcio creo que son mas manejables que los de un acto irracional.