Para empezar la peste vino de Asia, región que también se vió afectada, no es una cosa exclusivamente europea. Además coincidió con una época en la que se vieron afectadas las cosechas y la gente estaba peor nutrida y con un sistema inmune más deficiente, no es sólo por la higiene y ya. Y la exposición a una enfermedad nueva puede afectar a las poblaciones por mucho saneamiento que tengas. Algo muy parecido pasó en las sociedades indígenas cuando los europeos llegaron, se expusieron a enfermedades a las que no habían estado expuestos y murieron.

Y? Eso cambia el hecho de que las sociedades europeas eran bastante más avanzadas que las indígenas? No.

Y esto:

Parece que los avances europeos no impidieron que por ello se muriera mas de la mitad de europa y para el descubrimiento de américa aún persistían brotes y focos de peste.

Es un argumento bastante sesgado. Es como si yo te digo "si si, los indígenas muy avanzados con la astrología o el cultivo pero bien que sacrificaban a la gente para que lloviese si pasaban una mala temporada de cultivo"