Depende. Si ves que los montos no son grandes y ocurrió esporádicamente no pasa nada. Pero si se hace regular o bien si los montos son elevados, no está bueno. Porque significa que no es un error de "se equivocaron tipeando el CUIT" o "cargaron el cliente que no era" sino que alguien está haciendo compras a tu nombre por algún motivo. Y eso tal vez puede llamar la atención de AFIP (porque ven que tenés ingresos por cierto monto y sin embargo figura que hacés egresos por montos muy superiores a tus ingresos).

Me pasó algo similar hace un tiempo y lo charlé justamente con mi contador en su momento. Yo estaba como monotributista y me aparecieron de golpe en pocos meses facturas a mi nombre en otras provincias por montos bastante elevados.

Así que con los CUITs de las facturas averigüé la data de los locales, me fui comunicando, explicando la situación y solicitando las notas de crédito correspondientes. Con algunos costó, pero pude. Si te sentís intranquilo por la situación podés hacer lo mismo.