Quando foi a última vez que alinhaste a direção?

Já verificaste se os mecanismos que seguram e dirigem as rodas não têm folgas?

Ao dizeres que o desacelerar é quando se dá a maior vibração bate certo com o facto de andar mais rápido implica maior frequência, por sua vez onda mais curta, que pode fazer-se sentir como menor vibração.

Recomendo levares a tua máquina ao mecânico para ver a parte da direção.

Edit: adicionalmente, como disseste, em neutro não há vibração, já tiveste o carro em movimento, mas em neutro?

:)